home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00239 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.6 KB  |  59 lines
  1. ***********************************************************
  2. * Somatotropin, prolactin and related hormones signatures *
  3. ***********************************************************
  4.  
  5. The hormone somatotropin (growth hormone, GH)  which  plays  an important role
  6. in growth control, choriomammotropin (lactogen), a placental analog of GH; and
  7. prolactin which acts primarily  on  the  mammary gland by promoting lactation,
  8. have been shown [1]  to be homologous.  This family  of proteins also includes
  9. other hormones  listed  below    (references  are  only  provided for recently
  10. determined sequences).
  11.  
  12.  - Rodents placental lactogens I and II.
  13.  - Bovine and sheep lactogen.
  14.  - Mouse proliferin I, II, III and proliferin related protein [3].
  15.  - Bovine placental prolactin-related proteins I, II, and III [4].
  16.  - Rat placental prolactin-like proteins A and B.
  17.  - Human growth hormone variants 1 (GH-V1) and 2 (GH-V2).
  18.  - Somatolactin (SL) from various fish [5].
  19.  
  20. The schematic representation  of  the  structure of proteins belonging to this
  21. family is shown below.
  22.  
  23.         <----------------180-to-210-residues------------->
  24.                      ***                          *****
  25.         xxxxxxxxxxxxxCxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxCxxxCxxC
  26.                      |                            |   |  |
  27.                      +----------------------------+   +--+
  28.  
  29. 'C': conserved cysteine involved in a disulfide bond.
  30. '*': position of the patterns.
  31.  
  32. We developed two signature patterns for this family of proteins, both patterns
  33. include cysteines involved in conserved disulfide bonds.
  34.  
  35. -Consensus pattern: C-x-[ST]-x(2)-[LIVMFY]-x-[LIVMSTA]-P-x(5)-[TALIV]-x(7)-
  36.                     [LIVMFY]-x(6)-[LIVMFY]-x(2)-[STA]-W
  37. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  38.  for grass carp somatotropin, mouse  prolactin,  bovine  placental  prolactin-
  39.  related protein 3 and rat prolactin-like protein B.
  40. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: Herpes virus type I glycoprotein D.
  41.  
  42. -Consensus pattern: C-[LIVMFY]-x(2)-D-[LIVMFYSTA]-x(5)-[LIVMFY]-x(2)-[LIVMFY]-
  43.                     x(2)-C
  44. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  45.  for chicken prolactin, rat prolactin-like protein B  and human growth hormone
  46.  variant 2.
  47. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: 10.
  48.  
  49. -Last update: June 1992 / Text revised.
  50.  
  51. [ 1] Wallis M.
  52.      J. Mol. Evol. 17:10-18(1981).
  53. [ 3] Connor A.M., Waterhouse P., Khokha R., Denhardt D.T.
  54.      Biochim. Biophys. Acta 1009:75-82(1989).
  55. [ 4] Kessler M.A., Milosavljevic M., Zieler C.G., Schuler L.A.
  56.      Biochemistry 28:5154-5161(1989).
  57. [ 5] Rand-Weaver M., Noso T., Muramoto K., Kawauchi H.
  58.      Biochemistry 30:1509-1515(1991).
  59.